吴博君在70年代加入TVB，专演市井小人物、反派等配角，包括1996年版《笑傲江湖》桃谷四仙之一、黄日华版《天龙八部》的风波恶、陈小春版《鹿鼎记》吴三桂麾下武将杨溢之等，因有武术基础，擅长洪拳、少林拳，早年也从事替身工作，例如刘德华拍摄电影《魔域桃源》时，有一幕从2楼跳下的危险戏份，就是由吴博君代替拍摄完成。
1997年受金融风暴影响，吴博君被TVB裁员，为维持生计，他曾当酒楼、写字楼清洁工、面包师傅等，无奈造化弄人，2018年3月他在家中突感四肢乏力，就医证实罹患运动神经元疾病，即俗称的渐冻人，患有先天小儿麻痺的妻子因而辞职全天候照顾他，后期聘请外佣分担，但如厕、洗澡等仍需妻子协助。每月1万多元的照护开支，令吴家经济备感压力，刘德华、张卫健、古天乐、赵雅芝、王祖蓝等多名艺人都曾伸出援手。
遗孀今对《香港01》表示，吴博君在诊断出渐冻人症之前就已签下遗体捐赠，「他觉得人走了，身体也没有什么用了，但既然是没什么用的东西，能让它变得有用就是最好的」，于是她依照丈夫生前交代的心愿，安排他出院回家度过最后时刻，本月14日完成天主教丧礼后，便送往中文大学成为无言老师。
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