吴正己表示，针对女足事件，以最沉痛的心情，代表学校，向受害同学、家长，以及所有关心教育与人权的社会大众，致上最深的歉意。他在声明中提到，女足学生在未获妥善知情同意的情况下，长期配合研究抽血，且在师生关系不对等的权力结构下，遭遇言语威胁与心理压力。
吴正己指出，经本校研究伦理委员会调查与校园霸凌防治委员会审议，已确认涉案教师违反伦理规范，并构成对学生之霸凌。
声明中强调，此次事件是学校管理与监督的失责，学校会全面检讨教练聘任与考核制度、运动代表队的训练与课程设计，及学术研究伦理审查与监督机制，并负起相关责任：
1.教育部及各界对学校的严厉谴责，我们诚心接受，也对于女子足球队的学生，再次致歉。
2.对于三级教评会的决议，本校将立即启动程序、重新审议，并于二周内依法尽快完成相关惩处。
3.对于教育部、国科会，以及检调单位的调查，学校会全力配合，提供所需资料；校内调查若发现不法情事，也将主动依法究责。
4.在教评会重新审议过程中，校方会依教师法审议暂时停聘之处置，以避免教练与有关学生的任何接触行为。
5.学生反映受试费用未收到之情事，已正再次进行确认中，过往学生所有缴回作为队费的费用，一定会全数退还给予学生。
6.课程制度即刻调整：运动竞技学系大四之「专长训练」必修课程，已经教务会议决议，自下学期起改为选修，确保学生有自由选择的权利。
7.后续学生的咨商辅导，学校会持续关注，提供校内外相关的资源，帮助学生回复身心健康。
8.教育部对于学校、主持人及共同主持人研究伦理的处罚，学校坦然接受，未来将全面检讨学术伦理审查及督导机制，并推动提升学术伦理教育。
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