外界关注检方抗告理由之一是柯文哲与证人陈智菡接触，民众党前秘书长谢立功呼吁，相关证人应谨言慎行，避免成为检调突破口。对此，黄国昌回应，包括他本人、陈智菡及发言人吴怡萱等核心成员，从柯文哲遭羁押以来便长期检视事证与资料，掌握清楚脉络，但近期有过去不是那么关心案情的人，突然发表高见，提醒应先厘清事实，避免脱离现实。
黄国昌也批评，高院撤销理由之一是质疑北院前后判断不一，一个月前认为需羁押禁见，如今却改变看法；虽然重要证人多已交互诘问，但高院仍以部分证人如北市前都发局长黄景茂尚未诘问为由，认定有疑虑，但高院点名的名单中并未包含陈智菡、台北市议员陈宥丞。
针对赖清德总统召集「府院党三巨头」讨论柯文哲交保一事，遭民进党发言人吴峥批抹黑。黄国昌反击，当天柯文哲交保后，民进党与行政院高层确曾进总统府会商，随后北检晚间7时50分即宣布抗告，总统府8时40分又发稿批评柯文哲，整个过程「一条龙操作」清晰可见，「我讲的都是客观事实，哪一段是假的？」
对此，民进党发言人吴峥回呛，黄国昌持续用廉价抹黑方式攻击赖清德，只是企图刷存在感，未见民众党主席应有的格局。
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