三中案就蔡正元部分，高院判决指出，蔡正元担任阿波罗公司董事长，明知阿波罗为三方协议当事人，且为中影公司股权案的交易平台而持有中影公司股份，股份出售后所得价款应归阿波罗，待三方协议当事人进行分配，且蔡与阿波罗签订信托契约，由他担任阿波罗受托人，处理交易相关事宜，并取得4.3亿余元。但蔡因个人需求，利用担任阿波萝负责人及信托契约受托人机会，侵占新托专户内款项计2.8亿余元。
此外，蔡正元与阿波罗签署信托契约后，故意遗漏会计事项不记录致使财务报表不实，再委托不知情的记帐业者制作阿波罗财务报表时，未掲露上开信托契约事项，致阿波罗2007年度的财务报表不实。
合议庭认为，依照卷证资料，认定蔡正元犯业务侵占、背信及故意遗漏会计计载而不实记载等犯行，事证明确，原审认为蔡正元保有全部犯罪所得确有违误。因此撤销。至于量刑，审酌蔡正元以立委身分仲介中影股权交易案，并利用阿波罗负责人职务之便，输送利益给自己而掏空公司，严重侵害阿波罗利益，更使原委任阿波罗其余三方协议当事人权益受损，犯后否认犯行、迄未返还犯罪所得，因此量处3年6月徒刑，没收2.3亿余元犯罪所得，另蔡给妻子洪菱霙共4113万元部分也应予没收，此部分定谳。
蔡正元另被控违反《商会法》部分也事证明确，量处予6月，得易科罚金，因蔡正元上诉否认犯行，检察官也就原审不另为无罪谕知部分上诉，高院合议庭认为均无理由，判决驳回上诉。
三中案缘于《广电法》要求党政军须在2005年12月26日以前退出媒体经营，马英九2005年担任国民党主席后，为处理党产及退出媒体，委由中投公司出售华夏、中影等股权及旧党部大楼，最后衍生被控贱卖三中(中视、中影、中广)致国民党损失72亿余元，另蔡正元担任阿波罗公司负责人持有中影股份，出售后将原规阿波罗款项占为己有，共侵吞2亿8032万7983元，其中4113万元交给妻子。
一审马英九、前中投董事长张哲琛、总经理汪海清、蔡正元妻子洪菱霙、岳父洪信行5人均获判无罪，仅蔡正元被依业务侵占罪判刑3年6月，另违反《商会法》判刑6月，易科罚金，二审仍维持马英九等5人无罪判决，蔡正元则判3年6月定谳，但犯罪所得部分撤销改为2.3亿余元，另违反《商会法》部分仍判6月，得易科罚金6月，可上诉。
