农业部指出，第二阶段防疫重点包括全国猪场分级查访、加强毙死猪采检及肉品市场、屠宰场与化制场的环境清消。化制车与运猪车也列为稽查重点，确保不会因运输造成病毒扩散。目前全国防疫行动已启动，地方政府也配合进行分级分层访视及稽查。
环境部环境管理署则报告厨余清运与再利用状况，呼吁民众「在家吃多少煮多少、外出吃多少点多少」以减少厨余。厨余排出前要沥水，处理时以肥料化、能源化再利用为主，搭配焚化与掩埋。禁运禁宰期间已恢复正常清运机制，农业部并补助清运费用，确保厨余不积滞；各县市也要加强稽查厨余蒸煮猪场的申报状况。
应变中心最后提醒，全台养猪业者应持续落实人车管制与消毒，每日自主观察猪只健康，若发现出血等疑似非洲猪瘟症状，要立即通报当地防疫机关。为鼓励通报，农业部设有5千元奖励金制度，只要提供照片或影片，经检验确认采样者即可获奖。
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