柯文哲辩护律师萧奕弘表示意见，认为庭上不该以专业人士在场便勘验硬碟原档，仍应以检察官所提的映像档、证据副本进行勘验，确保证据「同一性」、「证据链完整性」，避免数位证据遭到变动，对此感到遗憾。针对内容部分，「A1-37」行动硬碟中有31万个档案，超过15000个文件档、6700多个WORD档、2750多个EXCEL档、3900多个PPT档、2000多个PDF档，柯文哲本人表示没印象有看过「工作簿」这个EXCEL档。
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萧奕弘指出，OFFICE系列文件的作者名称是一个「代号」，代表电脑名称、非识别码，是可以变动的，不能就此认定档案是由谁做的、谁修改的及输入其中何部分内容；作者「wen」也不代表是柯文哲，不代表档案就是柯文哲制作的。然而该EXCEL档已被媒体多次报导，审理期间也多次提及，但要指控柯文哲收贿仍要有明确证据。
面对萧奕弘数度提出「证据链断裂」的指控，法官许芳瑜似乎也颇有不满。她指出柯文哲辩护律师认为证据力有问题，却未在今日程序进行前具状声请以映像档方式勘验，也未对证据遭受污染有所疑义，先前更曾找过刑事警察局用设备以「不变动的方式」将证据烧录给辩护人的经验，然而辩护人仍未就今日勘验「资料由何人所做」的基础上，说明其与「证据链断裂」的关联性为何。
对此，检察官回应，基于直接审理原则，今天公开勘验「A1-37」行动硬碟，全程录音录影，确保无人为电磁纪录，并未改动原始证据内容，相关证物的保全也都有录音录影，查扣时的封条、公务员用印也都有，若详细阅卷可见查扣时照片，全程合法。
柯文哲辩护律师郑深元则主张，因「A1-37」行动硬碟是由检方声请勘验，应由检方订出如何勘验，以确保证据不遭受变动。眼见律师与法官争执不休，坐在郑深元、萧奕弘之间的柯文哲则是露出了一抹尴尬微笑。
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