台南市不仅是总统赖清德的本命区，也是本次民进党初选中内部竞争最为激烈的县市。陈亭妃与林俊宪皆深耕台南政坛长达27年，基层实力与政治资历不相上下。林俊宪在2024年立委选举中，因国民党对手王家贞仍在缓刑期间遭中选会取消资格，仅剩台湾双语无法党推荐的萧燐洪竞逐，最终以76.54%的得票率当选，创下全国区域立委最高得票率；陈亭妃则以陆战见长，长期穿梭地方活动，前两次立委选举皆拿下全市最高票，得票率同样突破七成，两人各自展现不同型态的选战实力。
相较林俊宪被视为赖清德嫡系大将，陈亭妃对此次台南市长选举的布局显得更为深层。其政治能量可从2024年民进党全代会中窥见端倪。当时陈亭妃自正国会体系分裂而出，在617名全国党代表投票中，以最高票当选中执委，并连动正国会的卓冠廷以1票之差落选；随后在10席中常委选举中，又透过精准配票与签运优势，挤下新潮流系统的林宜瑾，成功当选中常委，使其得以每周在中常会直接向党主席赖清德表达立场，展现其党内操作与政治实力。
初选前期，林俊宪将战火指向2018年台南市正副议长选举，指控当年陈亭妃胞妹陈怡珍与周丽津、吴通龙、郭信良等人跑票，导致民进党痛失正、副议长席次。林俊宪强调，地方议员至今仍对该次「叛党跑票」事件深感不满，并进一步指控陈亭妃借由国民党力量打击党内对手，称国民党立委谢龙介阵营议员私下支持陈亭妃，呼吁国民党勿介入民进党台南市长初选。
对此，陈亭妃强势反击，强调自己与谢龙介交手五次、五战全胜，「我跟谢龙介怎么可能会好」。针对议长跑票争议，她则回应，自己身分为立委，「议会的事情跟立法院有什么关系？」并指出台南市民关心的，是候选人对市政的规划与未来愿景，而非翻旧帐的政治攻防。陈亭妃也反批林俊宪「一直搬石头让总统担」，将与市政无关的议会纠葛加诸在赖清德身上，直言「总统是公共财，期待的是最强候选人，而不是方向完全错误的候选人」。
在政见方面，陈亭妃提出「科技三轴」、「四季农渔业」、「五大观光轴」、「福利六都齐」、「交通七彩行」等政策主轴，从产业、就业、观光到交通，全面串联溪北、溪南与沿海山区，强化整体城市竞争力。她也特别著墨教育、体育与公共安全，强调不能让孩子输在起跑点，须打造具国际竞争力的教育环境；体育政策则主张建立完整制度，让选手的付出不只停留在颁奖台上，包含分级训练、营养补助与长期保障。
在警消与防灾议题上，陈亭妃指出，自己担任义消顾问已28年，深知第一线人员的辛劳。面对极端气候成为常态，政府不能只靠运气，而应落实预防、常态演练与完整SOP，「宁可准备而不用，也不能临时慌乱」。她最后强调「行动政府」理念，市长在哪里，政府就该在哪里，走进现场、解决问题、把预算用在最需要的地方，这不是口号，而是她27年从政以来的日常。
林俊宪则在政见会上主打「回到市民本身」，认为台南下一阶段市政应全面强化社会福利与都市基础建设，让经济成长真正转化为生活品质提升。他提出多项高龄化政策，包括老人免缴健保费、重阳敬老礼金加倍至2,000元、每月500元敬老交通补助，以及全国首创为长者免费施打带状疱疹疫苗，强调「照顾老人，就是减轻年轻世代负担」。
在产业与交通建设方面，林俊宪提出「科技金三角」蓝图，串联南科、柳营科技园区与沙仑绿能科学城，推动柳营机器人产业园区与AI产业聚落，并协助争取三座跨越曾文溪的大桥，促进溪北与南科周边均衡发展；观光方面，则主打国际化布局，已协助台南机场恢复熊本、冲绳航线，并持续争取东南亚航线，提升台南的国际能见度。
在政治支持面向，林俊宪指出，目前已有25位市议员、3位立委表态支持，台南市长黄伟哲及前市长陈唐山也公开相挺；陈亭妃则获前总统陈水扁、立委王世坚支持，且先前多份民调显示，陈亭妃不论在党内互比，或对战国民党谢龙介时，皆维持领先。整体而言，台南市长初选胜负仍难预料，关键恐将回归双方的组织动员能力，以及核心支持者接听民调的纪律。
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